Desa Bantar Panjang merupakan desa hasil pemekaran dari Desa Dahu pada tahun 1983. Pemekaran desa ini karena wilayah desa sangat luas dan jumlah penduduk terus bertambah.

Setelah terbentuk, Desa Bantar Panjang dipimpin oleh Ahmad Suhaemi sebagai pejabat sementara kepala desa pada tahun 1984. Pada tahun yang sama kemudian dilaksanakan pemilihan kepala desa. Terpilihlah Suhaemi sebagai kepala desa hingga tahun 1986.

Saat ini, Desa Bantar Panjang dipimpn oleh Suharjo Noto Susanto hasil pemilihan kepala desa pada tahun 2019.

Sebelumnya, Suharjo Noto Susanto pernah menjadi kepala Desa pada periode sebelumnya hasil pemilihan kepala desa tahun 2012.